Pershing gagna ses galons de capitaine et commença à apprendre la langue moro afin de mieux pouvoir parler avec ses adversaires.
Il prit le commandement du Fort Padapatan situé sur le lac Lanao (Philippines) et tenta une approche diplomatique du problème.
Après un échec des pourparlers, Pershing lança ses troupes contre les Moro et prit le contrôle total de la zone du lac Lanao le 28 septembre 1901.
L'organisation et la conduite des expéditions contre les insurrections Moro furent remarquées et appréciées à Washington.